雷瓊世界地質公園博物館位于湖光巖景區西大門約100米處，是湖光巖的重要旅游配套設施之一。該館展覽面積約2500平方米，館內圖文并茂，內容豐富，深入淺出地介紹了雷瓊世界地質公園以及湖光巖的火山地質常識和演變過程，形象突出地演譯展示了雷州半島的火山地質內涵和火山生態資源。是集科普、教育、旅游于一體的科普展館。

該展館共有三層，一樓展廳介紹了雷州半島火山分布沙盤、雷瓊世界地質公園簡介、雷瓊火山知識、雷瓊民俗文化、雷瓊生態文化以及世界火山景觀等。二樓展廳分為影視廳和世界地質公園網絡展廳。影視廳主要播放湖光巖瑪珥湖地貌形成過程的三維動畫演示；世界地質公園網絡展廳介紹了雷瓊世界地質公園的建設與發展情況。三樓展廳是科普互動區，主要分為巖石小課堂及火山小課堂兩部分，用于作為“玩湖光巖”趣味知識問答、游戲、視頻的互動展示，通過各種各樣的巖石標本、礦物標本、火山道具、趣味問答等方式讓游客朋友及中小學生走進火山，感受神奇，是青少年學生們科普教育學習的新課堂。